El Colegio Hogar de Santa Margarita oferta todas las etapas educativas, desde 1º ciclo de Educación Infantil hasta el Bachillerato, además de un Ciclo Formativo Básico y un Ciclo Formativo Medio de Formación Profesional. En cada nivel educativo contamos con tres grupos excepto en Bachillerato, que la oferta es de dos grupos por curso, y en los Ciclos Formativos, que la oferta es de un solo grupo por cada curso.
El PIPE es un plan de plurilingüismo que oferta el centro y que trata de potenciar y mejorar la enseñanza de idiomas mediante actividades complementarias y extraescolares realizadas fuera del horario lectivo. La oferta de PIPE va desde Educación Infantil hasta Bachillerato.